Eddy menetap di Pulau Pinang untuk bersara. Selepas menamatkan kerjayanya sebagai pemain badminton, beliau membela anjing dan berlumba kereta pantas dan go-kart. Beliau merupakan pemandu yang baik dan membina nama dalam perlumbaan motor selepas memenangi banyak gelaran dari 1967 hingga 1982. Eddy juga merupakan pengerusi Kumpulan Hock Hin Bersaudara yang merupakan perniagaan keluarganya dalam pembangunan hartanah dan perumahan. Tambahan pula, Eddy terlibat di peringkat tinggi dalam persatuan kennel di Malaysia.

Pada tahun 1995, Eddy menjadi naib presiden Persatuan Badminton Pulau Pinang dan pengerusi Persatuan Teknikal Persatuan Badminton Malaysia. Beliau menumpukan perhatian pada pembangunan badminton di Pulau Pinang. Choong menggunakan wang sendiri untuk menukarkan kilang keluarga kepada stadium badminton dalaman pertama di Pulau Pinang. Beliau kemudian melaburkan RM 1.5 juta untuk membina Dewan Badminton Antarabangsa Pulau Pinang. Ia dibuka pada tahun 1992.